prot_struct.html

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Template Name: Trealop
Author: <a href="https://www.os-templates.com/">OS Templates</a>
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Copyright: OS-Templates.com
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Licence URI: https://www.os-templates.com/template-terms
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<!-- To declare your language - read more here: https://www.w3.org/International/questions/qa-html-language-declarations -->
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<title>G.P.S. Raghava</title>
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  <div id="topbar" class="hoc clear">
    <div class="fl_left"> 
      <!-- ################################################################################################ -->
      <ul class="nospace">
        <li><i class="fas fa-phone rgtspace-5"></i>011-26907444</li>
        <li><i class="far fa-envelope rgtspace-5"></i> raghava@iiitd.ac.in</li>
      </ul>
      <!-- ################################################################################################ -->
    </div>
    <div class="fl_right"> 
      <!-- ################################################################################################ -->
      <ul class="nospace">
        <li><a href="index.html"><i class="fas fa-home"></i></a></li>
        <li><a href="#" title="Help Centre"><i class="far fa-life-ring"></i></a></li>
        <li><a href="#" title="Login"><i class="fas fa-sign-in-alt"></i></a></li>
        <li><a href="#" title="Sign Up"><i class="fas fa-edit"></i></a></li>
        <li id="searchform">
          <div>
            <form action="#" method="post">
              <fieldset>
                <legend>Quick Search:</legend>
                <input type="text" placeholder="Enter search term&hellip;">
                <button type="submit"><i class="fas fa-search"></i></button>
              </fieldset>
            </form>
          </div>
        </li>
      </ul>
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</div>
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<div class="wrapper row1">
  <header id="header" class="hoc clear">
    <div id="logo" class="fl_left"> 
      <!-- ################################################################################################ -->
      <h1><a href="index.html">G.P.S. Raghava</a></h1>
      <!-- ################################################################################################ -->
    </div>
    <nav id="mainav" class="fl_right"> 
      <!-- ################################################################################################ -->
      <ul class="clear">
        <li><a href="index.html">Home</a>
	<ul>
            <li><a href="index.html">About Me</a></li>
            <li><a href="work_sum.html">Work Summary</a></li>
            <li><a href="awards.html">Major Awards</a></li>
            <li><a href="newspaper.html">News Papers</a></li>
            <li><a href="biodata.html">Brief Biodata</a></li>
          </ul>
	</li>
        <li><a class="drop" href="#">Web Services</a>
          <ul>
            <li><a href="database.html">Databases</a></li>
            <li class="active"><a href="prot_struct.html">Protein Structure</a></li>
            <li><a href="prot_func.html">Protein Function</a></li>
            <li><a href="vaccine.html">Vaccinomics</a></li>
            <li><a href="genomics.html">Genomics</a></li>
            <li><a href="biodrug.html">BioDrugs</a></li>
            <li><a href="interactome.html">Interactome</a></li>
            <li><a href="chemiinfo.html">Chemiinformatics</a></li>
          </ul>
        </li>
	<li><a class="drop" href="#">Research</a>
          <ul>
            <li><a href="publication.html">Publications</a></li>
            <li><a href="patents_copy.html">Patents/Copyrights</a></li>
            <li><a href="bookchapter.html">Book Chapters</a></li>
            <li><a href="major_project.html">Major Projects</a></li>
          </ul>
        </li>
	<li><a class="drop" href="#">Group Members</a>
          <ul>
            <li><a href="phd_student.html">Ph.D. Students</a></li>
            <li><a href="project_staff.html">Project Staffs</a></li>
            <li><a href="alumni.html">Lab Alumni</a></li>
          </ul>
        </li>
        <li><a class="drop" href="#">Teaching</a>
          <ul>
            <li><a href="courses.html">Courses</a></li>
            <li><a href="slides.html">Slides</a></li>
            <li><a href="preprints.html">Preprints</a></li>
          </ul>
        </li>
        <li><a href="contact.html">Contact Us</a></li>
      </ul>
      <!-- ################################################################################################ -->
    </nav>
  </header>
</div>
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<div class="wrapper row3">
  <main class="hoc container clear">
    <!-- main body -->
    <!-- ################################################################################################ -->
    <div class="content">
    <!-- ################################################################################################ -->
	<h1><strong>Protein Structure</strong></h1>
	<h2><strong>Protein Structure Prediction Servers</strong></h2>
	
      <div class="scrollable">
        <table>
          <thead>
            <tr>
              <th>Name</th>
              <th>Description</th>
            </tr>
          </thead>
          <tbody>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/alphapred/" target="_blank">ALPHApred</a></td>
              <td>A neural network based method for predicting alpha-turn in a protein.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/apssp/" target="_blank">APSSP</a></td>
              <td>Advanced Protein Secondary Structure Prediction Server.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/apssp2/" target="_blank">APPSP2</a></td>
              <td>Prediction of secondary structure of proteins from their amino acid sequence.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/ar_nhpred/" target="_blank">AR_NHpred</a></td>
              <td>Identification of aromatic-backbone NH interaction in protein residues.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/betatpred/" target="_blank">BetaTPred</a></td>
              <td>Statistical-based method for predicting Beta Turns in a protein.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/betatpred2/" target="_blank">BetaTPred2</a></td>
              <td>Updated statistical-based method for predicting Beta Turns in a protein.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/betatpred3/" target="_blank">BetaTPred3</a></td>
              <td>Propensity based prediction of beta turns and their types.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/betaturns/" target="_blank">BetaTurns</a></td>
              <td>Prediction of beta turn types.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="http://webs.iiitd.edu.in/raghava/bhairpred/" target="_blank">BhairPred</a></td>
              <td>Prediction of beta hairpins in proteins using ANN and SVM techniques.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/ccpdb/" target="_blank">ccPDB 2.0</a></td>
              <td>Compilation and Creation of datasets from PDB.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/fisipred/" target="_blank">FiSiPred</a></td>
              <td>Phi-Psi angle prediction using average angle prediction technique.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="http://osddlinux.osdd.net/raghava/pepstrmod/" target="_blank">PEPstrMOD</a></td>
              <td>Structural prediction of peptides containing natural, non-natural and modified residues.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="http://webs.iiitd.edu.in/raghava/proclass/" target="_blank">ProClass</a></td>
              <td> protein structure classification server.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/qaspro/" target="_blank">QASpro</a></td>
              <td>A webserver for the Quality Assesment of Protein Structure.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/sapdb/" target="_blank">SAPdb</a></td>
              <td>A database of nanostructure formed by self assembly of short peptide.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/sarpred/" target="_blank">SARpred</a></td>
              <td>A neural network based method predicts the real value of surface acessibility.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/satpdb/" target="_blank">SATPdb</a></td>
              <td>A database of structurally annotated therapeutic peptides.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/starpdb/" target="_blank">StarPDB</a></td>
              <td>A webserver for annotating structure of a protein using simililarity based approach.</td>
            </tr>
            <tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/tbbpred/" target="_blank">TBBPred</a></td>
              <td>A webserver for the prediction of transmembrane Beta barrel regions in a given protein sequence.</td>
            </tr>
            </tr>
              <td><a href="https://webs.iiitd.edu.in/raghava/tsppred/" target="_blank">TSPPRED</a></td>
              <td>A webservice for predicting Tertiary Structure of proteins.</td>
            </tr>





</table>
</main>
</div>
</div>

<!-- ################################################################################################ -->
<!-- ################################################################################################ -->
<!-- ################################################################################################ -->
<div class="wrapper row4">
  <footer id="footer" class="hoc clear">
    <!-- ################################################################################################ -->
    <div class="clear">
        <div class="copyright"><a href="http://iiitd.ac.in/" target="_blank"> IIIT Delhi </a>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="http://webs.iiitd.edu.in/" target="_blank"> Health Portal at IITD</a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="http://webs.iiitd.edu.in/raghava/" target="_blank"> Raghava's Group</a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="https://www.facebook.com/raghavagps" target="_blank"> FACEBOOK </a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="https://scholar.google.co.in/citations?user=XK5GUiYAAAAJ&hl=en" target="_blank"> SCHOLAR</a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="https://www.linkedin.com/in/raghavagps/" target="_blank"> LINKEDIN</a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="https://twitter.com/raghavagps" target="_blank"> TWITTER</a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="https://www.youtube.com/watch?v=V-0BTIKH78E" target="_blank"> YOUTUBE</a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<td><a href="https://www.researchgate.net/profile/Gajendra_Raghava" target="_blank"> ResearchGate</a></td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</tr>
        </fieldset>
      </form>
    </div>
    <!-- ################################################################################################ -->
  </footer>
</div>

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<!-- JAVASCRIPTS -->
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